违章建筑处理流程分为巡查检举告发、制止、通报、调查事实、处理、查证分析及处分。

一、 管理处系依据违章建筑处理办法，于发现违建或接获民众检举时，先汇整土地、建物资料办理会勘认定是否为违建，如是即进行查报通知作业，违建人于通知期限内未陈述、自行拆除或进行补照程序，将依规定排入拆除计画进行处分。
二、 如属程序违建，将通知违建人于收到通知后30日内补行申请执照，违建人之申请执照不合规定或逾期未补办申领执照手续者，将依规定排入拆除计画进行处分。
三、 如属实质违建无法补照且未于查报单规定期限内 自行拆除，亦将依规定排入拆除计画进行处分。