成立沿革

民國91年在台北陽明山召開之「國際自然保育聯盟世界保護區委員會東亞地區第四屆會議」，與會各國人士促請政府將東沙島附近海域，建立為我國第一個海洋保護區。民國92年10月在南非舉行之「第五屆世界公園大會」所達成之「德班協定」，籲請各國政府在未來十年內，將海洋保護區面積增加到領海面積的12%，並於民國101年建立全球海洋保護區資料庫。

民國92年8月6日行政院經建會函示：「東沙島環礁復育及保育，至為重要，除加強海巡署執法能力外，基於實務、專業及績效考量，是否有劃設為海洋型國家公園，並指定專責機關管理之需要，建請內政部會商相關機關，審慎規劃研究，妥擬可行方案，陳報行政院核定。」內政部營建署爰即委託專家學者進行可行性評估作業，並廣邀專家學者、機關代表及本部國家公園計畫委員會相關委員共同研議。

民國93年1月9日內政部將「東沙海洋國家公園可行性評估及劃設範圍」陳報行政院，案經行政院交經建會於民國93年2月2日第1163次委員會議討論後，於2月25日以院臺內字第0930006751號函核覆內政部：「東沙環礁為一完整之珊瑚礁，海洋生態環境獨具特色，生物多樣性高，為南海及台灣海洋資源的關鍵棲地，且東沙島環礁復育及保育工作至為重要，內政部所提『東沙海洋國家公園可行性評估及劃設範圍』，原則同意」。另行政院民國93年3月31日 召開「行政院海洋事務推動委員會第一次會議」亦指出行政院核示東沙島籌設「海洋國家公園」，具體宣示維護外(離)島之海洋生態環境，列入海洋資源組分工計畫，行政院永續會生物多樣性分組亦列為工作事項。

民國95年12月19日行政院核定內政部所報「東沙海洋國家公園計畫（草案）」，並請內政部依照該院經建會11月30日之審議結論及相關單位意見辦理：「（1）.本計畫名稱請修正為『東沙環礁國家公園計畫』，以凸顯所保育之東沙環礁生態系及地景特性。（2）. 原則同意『東沙環礁國家公園計畫』草案，並指示加速推動東沙環礁之復育及保育相關措施，優先辦理各資源復育措施，俟各項復育措施考核指標，顯示復育措施已達到一定成果後，方考慮推動後續之生態旅遊與環境教育工作。（3）. 『東沙環礁國家公園計畫』雖已單獨成立東沙環礁國家公園，然管理組織上應朝向合併設立一處『海洋國家公園管理處』，統籌東沙環礁及其他可能評估設立的綠島、北方三島、澎湖群島等島嶼或海洋型國家公園，以收整合管理之效。」

民國96年1月17日內政部公告「東沙環礁國家公園計畫書、圖」，東沙環礁國家公園正式成為我國第7座國家公園，也是第一座海洋型國家公園；民國96年10月4日海洋國家公園管理處於高雄市掛牌成立，為台灣海洋邁向永續經營的重要裏程碑。

海洋國家公園管理處於民國96年10月4日成立後，民國97年3月4日在東沙島設置東沙管理站，以落實東沙環礁國家公園各項現地經營管理工作，同時亦據行政院函示意見積極進行澎湖南方海域東吉嶼、西吉嶼、東嶼坪嶼、西嶼坪嶼及其周邊島嶼之海陸域生態資源、地形地質與人文景觀調查，據以評估設立國家公園之可行性與必要性。

民國99年11月17日內政部國家公園計畫委員會第89次會議審議通過「澎湖南方四島海洋國家公園可行性評估及劃設範圍草案」，本案後於民國100年12月29日經行政院交議行政院經濟建設委員會審議結論：「將澎湖南方四島劃設海洋國家公園，以積極進行保育，維護該地區之自然與人文資源，以期永續保存、共享，原則予以支持」，並奉行政院101年1月30日院臺建字第1010121882號函示依行政院經濟建設委員會研商結論辦理。

民國102年10月18日內政部國家公園計畫委員會第105次會議辦理審議通過「澎湖南方四島海洋國家公園之計畫書圖(草案)」，同年11月26日海洋國家公園管理處提送已修正之「澎湖南方四島海洋國家公園計畫(草案)」及計畫圖(草案)陳報內政部轉行政院審議。

行政院民國103年3月10日院臺建字第1030010925號函核定「澎湖南方四島國家公園計畫書」並函示澎湖南方四島國家公園成立後不設管理處，其經營管理納入海洋國家公園管理處既有之組織體制。內政部於同年5月28日公告，6月8日生效，澎湖南方四島國家公園成為我國第9座國家公園。

民國112年9月20日內政部國家公園署成立，本處由原「海洋國家公園管理處」調整為「內政部國家公園署海洋國家公園管理處」。

民國112年10月2日「內政部國家公園署海洋國家公園管理處」正式揭牌。

內政部國家公園署海洋國家公園管理處重要事件