澎湖南方四岛包含东屿坪、西屿坪、东吉屿与西吉屿，其蕴含三大特色：1.传统建筑与岛屿文化、2.海洋生物多样性生态资源、3.特殊玄武岩火山地景。海管处在兼顾资源保育与当地居民权益原则下，以永续生态岛屿为目标，积极推动澎湖南方四岛国家公园成立。

「澎湖南方四岛海洋国家公园可行性评估及范围划设说明书」于100年12月29日经行政院经济建设委员会审议原则通过，并已完成办理机关协调会与民众意见说明会，汇整多方意见于102年完成计画书之撰写并依程序陈报审议，103年3月10日行政院核定「澎湖南方四岛国家公园计画」书、图。内政部同年5月28日公告，6月8日生效，澎湖南方四岛国家公园成为我国第9座国家公园。

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