本处与国立中山大学东沙国际海洋研究站完成今(106)年度东沙环礁国家公园海域珊瑚礁总体检调查，本年度的东沙环礁珊瑚礁总体检调查结果，珊瑚平均复盖率约63%，环礁外测站主要受台风风浪影响，珊瑚复盖率略有异动，潟湖则因海水交换差珊瑚复盖率普遍偏低，仍以耐压型的团块珊瑚或叶片形珊瑚为主。

　　东沙环礁国家公园位于南海之北，由东沙岛及巨大的环状礁台组成，周围海水水深急遽下降，海水交换良好，因此有利珊瑚礁生长，本处与中山大学本年度共同进行8个固定测站共10条测线调查，礁台外的测站以南礁台珊瑚复盖83.75%最佳，其次为东礁台76.25%、北礁台61.25%，西礁台60%，潟湖内则内则因半封闭性的环境，水流交换不佳，夏季海水温度偏高且悬浮微粒高不利珊瑚生长，5条测线珊瑚复盖率平均仅33%，珊瑚复原脚步仍较为缓慢。

　　本年度调查结果发现环礁外侧的调查测站以南礁台最佳，珊瑚复盖率高，多由桌形或盘形珊瑚、表复型珊瑚等能抗海流的低矮形珊瑚组成，而北礁台及东礁台测站则发现受去年下半年及今年前半年侵袭东沙的台风影响，珊瑚复盖率略为下降，尤其北礁台105年度调查时89.0%的复盖率，今年已掉落至61.25%，在测线上亦可观察到许多珊瑚被移除后裸露出的岩石基底，由于北礁台测站是以软珊瑚为主要组成，因此较容易受台风风浪影响而脱落，此现象尤其在水深5-6米以内更明显。环礁潟湖内珊瑚生长则有几个不同类型，潟湖底部除因水温偏高，高悬浮微粒亦造成光线穿透力不足，因此仍不适珊瑚生长，依旧遍布死亡珊瑚碎片，复盖率约0-20%，但部分区域则有大面积的的片棘孔珊瑚生长，以东沙岛东的测站来说，复盖率高达85.63%，但线上几乎只有此类珊瑚，间杂一些耐高温及高悬浮微粒的蕈珊瑚及团块型珊瑚。而潟湖内由团块型珊瑚构成的块礁上珊瑚复盖率稍佳，约22-38%，由于潟湖内水温偏高，因此珊瑚组成仍以耐环境压力的微孔珊瑚、菊珊瑚、管孔珊瑚等为主，此类珊瑚多生长缓慢，因此珊瑚复原较慢，为此本处也在潟湖内陆续进行珊瑚复育的工作，在潟湖内寻找能耐较高水温的轴孔珊瑚品系，并进行移植，以增加栖地的多样性。

　　在指标生物方面，多数测站仍以蝶鱼、砗渠贝符合标准值，由于环礁外侧站珊瑚生长多为低矮丛生状，鱼类栖息空间有限，因此还是以小型鱼类为主，大型鱼类缺少躲避空间，多来来去去，定栖型的鱼较少，但反之，环礁潟瑚内因块礁有较多的栖息空间，因此反而可以观察到较多的大型鱼类，如鹦哥鱼、石鲈、刺尾鲷等，而整体指标鱼类以南礁台测站较为符合标准，而无脊椎动物除砗磲贝外，其它生物均不易见。东沙环礁国家公园除珊瑚礁外，亦有广大的海床，同样是重要的海洋生态系之一，目前也在进行开放生态旅游的评估方案，期待有朝一日，能早日与国人见面。

东沙环礁国家公园历年珊瑚礁复盖率调查结果

东沙环礁南礁台珊瑚生长极佳，鱼类丰度及多样性亦高

北礁台测站受台风影响，测线上部分软珊瑚已被移除，裸露出下方的岩礁

潟湖底部珊瑚布满死亡珊瑚碎片

环礁潟湖内部分地区已被片棘孔珊瑚复盖

潟湖内块礁构成的立体空间多，大型鱼类常在此间游移