兰屿得天独厚的地理环境及多样的自然生态，孕育出丰富的昆虫资源，根据研究，兰屿、绿岛的昆虫相虽然有部分的种类与台湾相似，但最主要的来源还是来自于菲律宾群岛。在长期的地理隔离下，形成许多特有种，兰屿是研究台湾本岛和邻近地区昆虫之生物地理学的理想岛屿。

岛上最引人注目的，莫过于绚烂亮丽的珠光凤蝶，雄蝶尾翅在阳光下折射出黄、蓝、绿色及珍珠色的光泽相当漂亮，2007年曾获选为台湾最美丽的蝴蝶。灌木丛上，球背象鼻虫浑圆黑亮的球身上镶着蓝绿色金属光泽的圆点或线条，十分可爱迷人。兰屿还有多样的甲虫、蜻蜓可以观察，而特有种的兰屿大叶螽蟖，和目前台湾地区发现最大型的竹节虫-兰屿筒胸，都是值得观察的昆虫。

此外，兰屿尚有许多独特的动物，如纯白几近透明色的兰屿光泽蜗牛素有兰屿最纯洁生命的动物之称；夜间活跃于森林中的兰屿角鸮，全世界只分布在兰屿，目前被列为珍贵稀有的保育类动物等等，都值得我们关注。