东沙环礁国家公园在成立后海洋国家公园管理处(以下简称海管处)开始进行海域复育工作，并在100年开始正式进行大规模的珊瑚复育工作，经过3年的扦插努力，目前海域珊瑚培育总数已超过一千馀株，而海管处调查人员更在今(103)年的珊瑚产卵调查中发现，培育三年的轴孔珊瑚已具有性生殖的能力，并一同加入本(103)年珊瑚产卵的行列，此一令人振奋的好消息让海管处的保育人员对长期抗战的海洋保育工作打入一剂强心针。

　　海管处表示在1998年的全球珊瑚大白化事件中，东沙环礁的珊瑚礁生态严重受损，直至今日，虽已日渐恢复，但环礁潟湖中的分枝型轴孔珊瑚复原缓慢。由于分枝型的轴孔珊瑚形成的三度立体空间可提供生物安全的栖息空间，对生物资源的恢复有很大的助益，因此为目前主要复育的物种。初期海管处人员在经过栖地的现况调查与寻找适合做为移植的耐热品系珊瑚后，发现利用植物扦插方式在珊瑚礁块的孔隙间无性培育珊瑚分枝，不仅存活率高且成长迅速，水下操作容易且移植成本亦较低，适合目前的大范围的海域复育工作。而经过调查，这些分株培育的轴孔珊瑚，在第二年的已形成致密的空间可有效的吸引各种生物进驻，更在此次珊瑚产卵调查中发现培育三年，成长超过50公分的珊瑚群体也一同加入有性生殖的行列。

　　海管处目前的复育策略是希望能在东沙环礁潟湖内建立10个分株复育的基地，并透过点线面的连结提高珊瑚的有效族群数后，透过珊瑚有性生殖的方式来自行恢复族群量，进而建立一个适合生物栖息的空间。此外为了恢复栖地的生态，海管处也与国立中山大学及澎湖县水产种苗繁殖场一同合作进行藻食性生物的复育，目前已成功复育砗渠贝及马蹄钟螺，并将培育至适当大小后，放流至邻近海域。
东沙环礁位居南海北端，在辽阔的大海中，犹如一座珍贵的绿洲，为海洋延续生命，而珍贵的海洋生态更吸引研究学者纷纷前往探索生命奥妙。国家公园的成立让海管处肩负保育与复育的重责大任，目前的保育成效让海管处同仁更期许未来，能再创东沙荣景。

海管处人员利用珊瑚分株扦插的方式进行珊 瑚复育	经过三年的培育，珊瑚已成长为一个小群体
培育两年的分枝型轴孔珊瑚形成致密的立 体空间，已形成生物安全的庇护所	培育三年的轴孔珊瑚，在今年发现加入珊瑚 产卵的行列
马蹄钟螺可清除附着性藻类，帮助珊瑚苗 的附着，为目前重要的物种之一	培育8个月的砗渠贝种苗