由本处委讬专业研究团队调查东沙岛陆域生态，近3年研究成果中，了解东沙岛上现有两种野生的囓齿目动物，分别为家鼠（Rattus sp.）和家鼷鼠（Mus musculus），均为外来的入侵种。囓齿目动物在东沙岛上所造成的危害至少有：伤害原生种植物的群落、传播人类疾病（例如恙虫病），以及损坏贵重的仪器和设备等三项。为此本计画于第一阶段以普查的方式确定现存鼠类的分布地点，并于第二阶段中，以捕捉或其他方式运用，以完全清除岛上的啮齿目动物，并规划长期监控的方案。全面移除东沙岛上的囓齿目动物将有助于未来原生植被的复育，且在环境卫生及危害防治上有所贡献。