由本處委託專業研究團隊調查東沙島陸域生態，近3年研究成果中，了解東沙島上現有兩種野生的囓齒目動物，分別為家鼠（Rattus sp.）和家鼷鼠（Mus musculus），均為外來的入侵種。囓齒目動物在東沙島上所造成的危害至少有：傷害原生種植物的群落、傳播人類疾病（例如恙蟲病），以及損壞貴重的儀器和設備等三項。為此本計畫於第一階段以普查的方式確定現存鼠類的分布地點，並於第二階段中，以捕捉或其他方式運用，以完全清除島上的嚙齒目動物，並規劃長期監控的方案。全面移除東沙島上的囓齒目動物將有助於未來原生植被的復育，且在環境衛生及危害防治上有所貢獻。