海洋国家公园管理处(以下简称海管处)为避免头巾屿燕鸥受到民众之干扰，目前不开放一般民众登岛。另为发挥环境教育功能，同意进入头巾屿延伸之海蚀平台之人数，每日调整为60人。

海管处受澎湖县政府委讬管理澎湖南海玄武岩自然保留区(包括东吉屿、西吉屿、头巾屿、铁砧)，头巾屿依南海玄武岩自然保留区之公告，仅开放学术研究及专案调查作业之人员进入，并不开放一般游客申请进入。上述研究及调查每日承载量规定为30人，另因考量该区为燕鸥重要栖息及繁殖地，为避免干扰燕鸥之生态，目前仅同意限量的民众进入头巾屿自然保留区延伸之海蚀平台。今为满足推动环境教育之量能，同时也能加强保育之效果，并兼顾澎湖南方四岛社区举办环教活动的要求，该「海蚀平台」每日同意进入的人数，由现行30人调整为60人并禁止进入自然保留区。相关申请资讯及表格可至海管处官网查询。

海管处提醒进入头巾屿海蚀平台活动前应注意潮汐时间，同时注意海象变化，活动期间禁止捕捉生物及餵食、干扰燕鸥，也不要遗留垃圾，请游客务必遵守相关规定，爱护美丽的环境。