有关多家新闻媒体于本(108)年1月31日报导，略以：「澎湖南方四岛国家公园拟设自然人文生态景观区，实施登岛管制收费措施，展开巡回说明会，因渔民批评海管处划大饼，抱怨未来渔船进出都要申请等，当场翻桌、摔椅子，双方不欢而散」1事。海洋国家公园管理处提出说明。
　　「澎湖南方四岛国家公园」于103年6月成立后，游客量大幅成长，统计100至102年前往南方四岛每年游客数约4800至8200人，至107年全年游客数已达38000人；因既有游憩方式多由马公南海游客中心搭乘观光游艇前往七美等观光，顺道于东吉、东屿坪短暂停留，以走马看花式的进行岛上游憩活动，过去社区民众多有反应游客到访，消耗地方水、电资源外，对于地方经济并无实质助益。
　　行政院于公共政策网络参与平台讨论后，续于106年12月13日召开记者会交办内政部推动「澎湖南方四岛国家公园划设为自然人文生态景观区」，系为协助地方转型，并辅导发展生态旅游及导览解说活动，依据「发展观光条例」等相关规定，筹划澎湖南方四岛国家公园成为「自然人文生态景观区」，研拟培训社区居(渔)民转型成为专业导览人员；未来游客进入澎湖南方四岛须申请并由当地专业导览人员陪同下，每团体以20人(含以下)须付费2,400~3,600元。换言之，透过划设「澎湖南方四岛自然人文生态景观区」，辅导并培训当地居民成为专业导览人员，除收取导览费用外，亦能提供游客导览解说服务，深入了解澎湖南方四岛特殊的历史、人文、海岛风情。
　　海管处表示，于本年1月30日在澎湖县望安乡东吉与东屿坪各举办一场说明会，据了解东吉社区少部份民众认知疑遭扭曲并鼓动，担心划设后将限制海上渔业活动，因而发生闹场情事，民众抗议行为短暂中断说明会进行，在恢复会场秩序后，海管处重申现阶段国家公园海域有关渔业资源管理，仍依据澎湖县政府公告相关渔业规定办理，本次推动自然人文生态景观区划设并无涉禁渔事项。社区民众事先因不了解规划推动内容，后经海管处说明后逐渐回复平和，并能踊跃表达意见。
海管处表示，办理说明会就是要听取社区民众意见，且国家公园设立后，虽完成多项公共服务设施，如凉亭与步道改善，兴建海水淡化厂二座与送水到府接管工程、公厕改建等，然相关基础建设尚未能一步到位，符合社区期待。未来仍将积极与地方政府机关协调共同推动，以期望建设南方四岛成为海上乐园之目标。