台湾产梭子蟹科共有 18 属 71 种, 常见于河口、海岸、珊瑚礁潮间带与亚潮带等栖地。澎湖群岛位于台湾西侧的台湾海峡上, 珊瑚礁多样性高, 具有梭子蟹科物种的栖地。之前于南方四岛记录的梭子蟹科物种, 共 3 属 3 种, 由于未曾针对此区域的蟹类进行详尽调查, 可能低估此地区梭子蟹的多样性。近年来分子技术日益普及, 经分子技术检验并搭配形态分类, 可使物种的鑑定更加准确。本研究分别于 2020 年 5、8、9 月, 于东屿坪屿、东吉屿二岛进行梭子蟹科物种的调查, 除了提供此地区梭子蟹科物种完整的物种组成与分布状况外, 也建立此二岛梭子蟹的 DNA 条码 (DNA barcode) 数据库。以形态鑑定搭配分子分析, 共发现 8 属 22 种的梭子蟹科蟹类, 其中有 20 种为南方四岛的新纪录物种。物种组成方面, 梭子蟹多样性最高的样区为样区二 (位于东吉屿下坪与码头南侧; 主要栖地以沙质底, 部分地区长有海草, 中间散布些许礁石与少量的珊瑚), 共发现 17 种梭子蟹, 其中又以东吉屿码头的栖地最为特殊, 部分种类仅发现于此。样区三 (位于东吉屿东岸薰衣草森林; 水下栖地以珊瑚为主) 仅记录 1 种梭子蟹, 为目前调查中多样性最低的样区。本研究提供东吉屿、东屿坪屿初步的梭子蟹类调查, 未来有待进行更多的调查, 为底栖生物保育提供重要的基础。