台灣產梭子蟹科共有 18 屬 71 種, 常見於河口、海岸、珊瑚礁潮間帶與亞潮帶等棲地。澎湖群島位於台灣西側的台灣海峽上, 珊瑚礁多樣性高, 具有梭子蟹科物種的棲地。之前於南方四島記錄的梭子蟹科物種, 共 3 屬 3 種, 由於未曾針對此區域的蟹類進行詳盡調查, 可能低估此地區梭子蟹的多樣性。近年來分子技術日益普及, 經分子技術檢驗並搭配形態分類, 可使物種的鑑定更加準確。本研究分別於 2020 年 5、8、9 月, 於東嶼坪嶼、東吉嶼二島進行梭子蟹科物種的調查, 除了提供此地區梭子蟹科物種完整的物種組成與分布狀況外, 也建立此二島梭子蟹的 DNA 條碼 (DNA barcode) 資料庫。以形態鑑定搭配分子分析, 共發現 8 屬 22 種的梭子蟹科蟹類, 其中有 20 種為南方四島的新紀錄物種。物種組成方面, 梭子蟹多樣性最高的樣區為樣區二 (位於東吉嶼下坪與碼頭南側; 主要棲地以沙質底, 部分地區長有海草, 中間散佈些許礁石與少量的珊瑚), 共發現 17 種梭子蟹, 其中又以東吉嶼碼頭的棲地最為特殊, 部分種類僅發現於此。樣區三 (位於東吉嶼東岸薰衣草森林; 水下棲地以珊瑚為主) 僅記錄 1 種梭子蟹, 為目前調查中多樣性最低的樣區。本研究提供東吉嶼、東嶼坪嶼初步的梭子蟹類調查, 未來有待進行更多的調查, 為底棲生物保育提供重要的基礎。