澎湖南方四岛国家公园之设置，主要系为维护澎湖南方四岛之玄武岩地质、珊瑚礁生态与历史人文地景等三大核心资源。「澎湖南方四岛国家公园计画」经行政院于103年3月10日核定，澎湖南方四岛国家公园于103年5月28日内政部公告，6月8日生效。