目前往返台湾及东沙岛最主要及便捷为航空，固定每月一架次军机及每周一架次民航机，主供物资运补及公务使用，尚无开放民众搭乘，单程飞行时间约70分钟。另配以军用补给舰、民用商船等船舶载运生活物资、柴油、机具、车辆、建材等重吨资材，航行时间需视船型、天候及海况条件决定，约在16至20馀小时不等。