澎湖南方四岛因受地理位置及环境影响之限制，交通水利等公共设施施作困难，一般自来水建设所需投资极大且营运成本高，无法普及供应，目前东屿坪及东吉屿仍无自来水供应，岛上居民生活用水均主要来源为地下水源及井水，惟地下水有限且原有供水管线老旧漏水严重及抽水设施老旧，造成供水量受限且水质不稳。为提升东吉屿及东屿坪岛上生活用水品质，提供岛上人员安全且适足之饮食用水，本处办理「澎湖南方四岛海水淡化厂新建工程(东吉屿及东屿坪)」-包含取水工程、慢滤池工程、管线工程、储水池工程、海淡机房工程(自主发电及每日23公吨淡化机组)，已于106年10月完工，经海淡机组试运转后，已于12月13日验收完成，预计于107年1月初正式启用。

东吉屿海水淡化厂

东屿坪海水淡化厂

　　本工程设计采用薄膜逆渗透方法，配合能源回收装置，降低耗电量；启用处理后之水质符合「自来水水质标准」，将可提供生活用水量约每日20公吨及生饮水水量约每日3公吨；所有管线与海水接触之材质，系采用不锈钢或耐盐化及耐腐蚀材料，可延长使用年限，相关设计准则系依据中华民国国家标准及相关法规办理。

　　另为避免海水淡化所产生卤水影响当地珊瑚礁生态环境，本案施工前已事先审查预先评估环境影响。本案海淡厂所产生卤水约每日52公吨，相当每分钟36公升之卤水排至大海，为了减少卤水对排放口附近的影响，特于排放前再抽取原海水与卤水混合稀释后予以排放。经实际采取水样送专业机构检验结果，卤水盐度52.7mg/L，抽取原海水盐度31.7 mg/L，卤水与原海水混合后于排放口所测海水盐度32.1 mg/L，经排放后离放流口20公尺之水质盐度为31.4 mg/L，由于当地海水交换良好且排放量极小，经海水稀释后与当地水域海水水质相近，对海洋生态影响甚微。