澎湖县东吉屿系位于澎湖县南方海域的火成岛，佔地面积约177公顷，主要植群生态系为草原生态系。全世界海洋岛屿约佔整体土地面积的3%，然而却拥有高比例的特有种，是全球生物多样性热点区域，由于海洋岛屿受到隔离作用，限制了岛屿上陆域生物与其他大陆生物的基因交流，因此岛屿具有独特的功能性状、特殊的演化现象以及高比例的特有种，东吉屿亦不例外。东吉屿有着许多台湾海岸栖地的稀有植物，如沙生马齿苋(Portulaca psammotropha)、密毛爵床(Justicia procumbens L. var. hirsuta)、香茹(Glossocardia bidens)、变叶立牵牛(Ipomoea polymorpha)、澎湖决明(Cassia sophera var. penhuana)、澎湖大豆(Glycine tabacina)等。而草原生态系佔全世界植群生态系面积约40%，为人类放牧及草食动物取食的重要资源。东吉屿自日治时期即有放牧羊只的纪录，然而羊只对当地植群的影响与机制却难以评估。本实验利用次世代定序及围栏法，评估羊群的食性以及对植群变迁的影响。研究结果发现，土壤裸露较多的区域，在移除羊只后，外来入侵植物有爆发的可能，亦显示羊只干扰有抑制外来种扩张的功能。而一年生草本优势的草原生态系，则因地上部茂密的复盖及可快速恢复的生物量，对于羊只干扰以及强势物种侵入的耐受性较高。