随着海洋生物资源的相关研究不断更新，海洋生物资源之二次代谢物显见更多的医药开发应用。澎湖南方四岛得天独厚的生态环境，促成丰富的生物多样性，也推估南方四岛的微生物的多样性及特殊功能性的生物资源定有更多待研究之处。本次研究我们想进一步探讨南方四岛东吉屿与西吉屿之海洋无脊椎动物共生菌及其二次代谢物之分析及生技应用。我们用Staphylococcus aureus (金黄色葡萄球菌)、Salmonella typhimurium (鼠伤寒沙门氏杆菌)、Acinetobacter baumannii (鲍氏不动杆菌)、Pseudomonas aeruginosa (绿脓杆菌)、Escherichia coli (大肠杆菌) 及Candida albicans (白色念珠菌) 这6种指标微生物去做抗菌活性筛选。在有氧条件下，我们发现了14株具有抗菌活性之菌株 (尚未鑑种完成)，且多数菌株对S. aureus具有抑制活性。另外，在厌氧环境下，我们分离出14株兼性厌氧菌以及一株有氧条件下分离出的兼性厌氧菌E11-A，其中2株(包含前述兼性厌氧菌株E11-A) 于厌氧环境下会释放出黑色物质至培养基中，但兼性厌氧菌株E11-A回复到有氧环境后，培养基颜色又会退回原本之颜色。在初步抑菌活性试验下，此15株兼性厌氧菌株萃取物尚未观察到明显的抑制活性表现。