计画于2022年4月起至2023年3月间以每两个月一次的野外调查与采集的方式同时对四个主要岛屿与两个次要小岛所选定的16个不同采样点之亚潮带以及两处潮间带进行底栖大型藻类相以及环境参数（温度，盐度，pH与营养盐）同时监测。亚潮带调查结果共记录到73种不同的大型藻类，其中最多的是红藻。分布最广且出现频度最高的是趋化蕨藻，石莼，及巢沙菜。各个样点间之藻类群聚生物多样性指数最高的是东屿坪东南（3.0），最低的是西屿坪北（1.8）。大型藻类群聚相似度最高的是东吉东西两侧的样（80%）。样点间大型藻类群聚有明显分群（nMDS; stress = 0.15），岛屿间藻类群聚相似度亦有显着差异（ANOSIM Global test; p < 0.001）。主要优势种如：巢沙菜在八九月时出现频度最高；芦笋藻则是每年十月至隔年三月出现频度最高；脆红网藻，石莼与趋化蕨藻的高峰则在夏季的六至九月。建议在藻类群聚生物多样性最高的几个样点可以进行长期监测。往后调查可以针对丰富度较高的藻种进行调查与监测。
