一、澎湖南方四島國家公園位於澎湖南方海域望安嶼及七美嶼以東的位置，範圍界於東經119°27'51"至119°43'04"、北緯23°12'05"至23°19'28"間，總面積為35,843.62公頃、海域面積35,473.33公頃、陸域面積370.29公頃。

二、範圍內有四個主要島嶼：東吉嶼、西吉嶼、東嶼坪嶼、西嶼坪嶼，以及數個小型島礁：鋤頭嶼、頭巾、鐵砧、二塭、香爐、豬母礁、鐘仔、柴垵塭、離塭仔等。