東沙環礁國家公園位在台灣的西南方海域，介於香港、台灣與菲律賓呂宋島間，東控巴士海峽，西扼海南島、廣東及港澳船艦進出之門戶，地理位置十分優越。在地理位置上，東北距高雄450公里（航空飛行時間約70分鐘）、澎湖430公里，南距南沙太平島1,185公里。為南海諸島中位置最北之島嶼，目前行政區域係屬高雄市旗津區。

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