| 摘 要 |
介紹 東沙群島特殊的環礁結構以及位在緯度較低的地帶，孕育了種類眾多的珊瑚、藻類、魚類、還有其他的生物等，在這樣的環境之下也有許多的微生物生存。也因為東沙島與台灣有不同的氣候環境，而且少有人為的活動也沒有過多的汙染，因此保留較為原始的天然環境，然而目前對於東沙島微生物菌相的研究報告並不多。因此，本次的研究是要對東沙群島的菌相做一些初步的調查分析，主要是先以該島的潟湖和周邊水域做為採樣地點，並對所採集的微生物做簡單的分類、親緣關係的探討，以及物種定序比對。 研究方法過程 將採集的海水用無菌過濾瓶以0.22m的無菌濾紙過濾，萃取殘留在膜上的微生物DNA，利用聚合酶鏈鎖反應 (PCR) 專一的引子放大其 16S rDNA 片段，純化後送入載體，利用colony PCR反應確認有轉殖成功菌落，再配合變性梯度電泳- (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis，DGGE)，篩除可能重複的序列片段，送至生技公司定序，再將定序結果與 National Center for Biotechnology Information (NCBI) 網站的資料庫進行比對，依照相似度判斷可能的菌種。 結果 根據 DGGE 條帶數計算結果，東沙島周圍以採樣點1的18條最多、採樣點2的10條最少，小潟湖以採樣點7的19條最多、採樣點5的6條最少；以DGGE條帶相似度顯示，東沙島周圍採樣點2、採樣點3較為類似，採樣點1、採樣點4較為類似，小潟湖採樣點5、採樣點6、採樣點7較為相似。由各採樣點的菌相分布來看，東沙島周圍以 Gammaproteobacteria占最多、Alphaproteobacteria 其次，小潟湖以 Gammaproteobacteria 占最多、Bacteroidetes 其次；將序列比對後的菌相結果分類，顯示 Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides (CFB) group、Chloroflexi、Chroococcales、Cyanobacteria的菌種，只出現在東沙島周圍的採樣中，Epsilonproteobacteria、Bacteroidete、Anaerolineae、Thermomicrobia 的菌種，只出現在東沙島小潟湖的採樣中，兩部份各有其獨特菌種。 |
