出版品
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波光綠茵-東沙海草床
臺灣地區有紀錄的海草共10種，而東沙環礁海域紀錄到7種，包括2種臺灣新紀錄種，東沙環礁內水深多在20公尺以內，適合海草生長，因此構成臺灣種類最多、面積最大的的海草床，並提供魚蝦貝類重要孵育場所，本解說手冊即海草床生態系統的縮影，清楚明快地告訴國人海草床所提供的生態服務。
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藍色珊瑚海攝影集
東沙環礁坐落臺灣西南方，擁有珊瑚、魚類、貝類、無脊椎動物及臺灣最大的海草床生態等珍貴資源，本攝影集以「珊瑚海色」、「凝眸華麗波流」、「輕問白沙」及「光羽婆娑影舞」等四大主題，展現東沙空拍、海底生物、陸上與鳥類資源及晨昏雲彩變化之美，輔以優雅文字，期能領讀者用美的角度品讀東沙環礁獨特之美，領略東沙的細緻生命，分享東沙環礁每個角落獨樹一幟的生態風貌與精彩。
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漂流萬里─東沙草木誌
根據過去調查的資料，分析植物地理分佈及傳播機制，發現東沙島的植物大部分是經由「海漂」進駐東沙島，因此「漂流萬里-東沙草木誌」的作者郭城孟教授，將東沙島的生態地位定義為亞洲熱帶海岸林，也是本書命名的依據，全書彩色印刷，手繪圖的封面，故事性十足。
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四海遊蟲－東沙昆蟲記
東沙島無山、無河、無土，僅覆蓋著由珊瑚及貝類等生物碎屑堆積而成的富含碳酸鈣質的白砂，加上缺乏淡水，植物生長極其艱困，植被多以低矮的熱帶灌叢為主，是許多熱帶植物分佈的北界，島上的植物約211種，竟有約185種昆蟲以島上植物為生，佔昆蟲比例之48%，從大比例的「植食特性」可知東沙的昆蟲社會仍處於發展階段；同時，東沙島扮演了汪洋大海中繼站的功能，匯聚來自各方的島嶼遷移性物種，多樣性豐富。
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認識東沙
本處對東沙環礁國家公園從陸域生態調查、鳥類繫放和無脊椎動物調查，到水域珊瑚礁生態系的監測和海洋環境因子的建置及對人文、考古做持續的資料蒐集、考 據，累積了很多成果，本書利用歷年來的保育研究成果，將東沙環礁國家公園的人文、歷史和生物多樣性資訊彙整成詳細有簡潔的文字說明，並配合許多精彩的生態 照片，透過精心的編排，將東沙的美麗呈現在國人面前。就讓我們一起來「認識東沙」吧。
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羽戀東沙
本處2009年12月出版的第一本介紹東沙島鳥類的解說叢書－羽戀東沙，收錄島上常見鳥種50餘種，搭配各式鳥類圖片，以深入淺出的方式介紹島上鳥類的生活習性，希望民眾藉本書的出版，有機會瞭解東沙島鳥類資源的多樣性。
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東沙記憶
歲月飛馳，潮汐來回，數不盡的過去，紛紛被吹散在風裡。那歷史的跫音，輕輕的，在這片海域迴響。 記憶穿過舊時光，串連了往事，又向未來蔓延，而東沙的故事未完，傳奇仍在譜寫，一如她的美麗，將會永遠持續。
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澎湃列島 (DVD)
黑潮，是太平洋上最強勁的一股洋流，它串連起眾多島嶼的身世，演繹著各種令人動容的傳奇。台灣，位居黑潮之畔，周圍許多嶙峋的島嶼包刮蘭嶼、綠島、龜山 島、澎湖以及位處南海的東沙環礁受到黑潮洋流的顯著影響讓我們隨著大海的節奏，一起去鳥瞰這寰繞西太平洋彼岸的眾島風情，並且潛入海底，去經歷洋流的脈 動，一同去領會澎湃列島的震撼與美麗。